Implementación de estándares DICOM para patología digital.
Introducción
DICOM es el estándar para la representación, el almacenamiento y la comunicación de imágenes médicas e información relacionada. Se ha definido un formato de archivo DICOM junto con un protocolo de comunicación para la patología, sin embargo, los vendedores y en general el área no han terminado de adoptar esta. Debido a esto es que se evaluaron las capacidades, se implementaron los aspectos esenciales del estándar y se analizaron sus limitaciones en una red de múltiples sitios de atención médica junto con diversos proveedores.
Metodología
En primer lugar, se seleccionaron atributos relevantes de DICOM. En segundo lugar, se desarrolló un programa de extracción de datos de píxeles y metadatos de estos, en el cual se integró la metadata del paciente junto con varias muestras y documentos DICOM almacenados. A continuación, se crearon los documentos usando los datos de la imagen de cuatro diferentes formatos de archivo de imagen del proveedor. Asimismo, se usaron metadatos clínicos de dos departamentos con distintos sistemas de información de laboratorio.
Finalmente, se validaron los datos generados por los archivos DICOM utilizando herramientas de validación DICOM (las cuales son ampliamente reconocidas) y midiendo la codificación, el almacenaje y la eficiente accesibilidad. Esto se realizó para tres métodos de compresión de imágenes.
Resultados
Todos los datos se pudieron codificar juntos como objetos DICOM, con metadata sobre el paciente y las muestras. Se puede acceder de manera eficiente a estos objetos desde archivos o a través de sitios web RESTful, haciendo uso de implementaciones de softwares existentes.
La medición del rendimiento muestra que la elección del método de compresión de imagen tuvo un mayor impacto en la eficiencia al acceso de datos. Para la compresión con pérdida, JPEG tiene las tasas de compresión y descompresión más rápidas, además, si se busca tener una compresión sin pérdidas, JPEG-LS supera ampliamente a JPEG2000 en lo que corresponde a velocidad de codificación de datos.
Conclusiones.
La implementación de DICOM permite una accesibilidad eficiente a los datos de las imágenes, así como a toda la metadata relacionada. Al aprovechar una gran cantidad de soluciones de infraestructura, el uso de DICOM facilita la integración y el intercambio de datos para patología digital.
Traducido y adaptado de: Herrmann, M. D., Clunie, D. A., Fedorov, A., Doyle, S. W., Pieper, S., Klepeis, V., Le, L. P., Mutter, G. L., Milstone, D. S., Schultz, T. J., Kikinis, R., Kotecha, G. K., Hwang, D. H., Andriole, K. P., Iafrate, A. J., Brink, J. A., Boland, G. W., Dreyer, K. J., Michalski, M., Golden, J. A., … Lennerz, J. K. (2018). Implementing the DICOM Standard for Digital Pathology. Journal of pathology informatics, 9, 37. Recuperado de: https://doi.org/10.4103/jpi.jpi_42_18
